Der er tilknyttet et fagligt vurderingspanel til VUDP-Foreningen. Det faglige vurderingspanel har til opgave at vurdere projektansøgninger og træffe den endelige beslutning om uddeling af midler efter lovgivning, foreningens vedtægter og uddelingsvilkår samt det, af bestyrelsen, fastsatte uddelingsbeløb.
Det faglige vurderingspanel er sammensat af syv medlemmer. Fem medlemmer, herunder formanden, udpeges af generalforsamlingen. De resterende to medlemmer er henholdsvis én repræsentant fra forskningsverdenen og én repræsentant fra vandsektorens leverandører. Disse to udpeges af vurderingspanelet.
Det faglige vurderingspanel fungerer på frivillig basis og modtager ikke honorar for hvervet.